公司合同专用章和公章区别主要体现在使用范围、执章人、管理部门、权利和确认力以及刻制等方面的不同。分公司合同专用章是需要到公安机关进行备案登记的。
一、公司合同专用章和公章区别
公司合同专用章和公章的区别在：
1.使用范围不同。
(1)公章适用范围广泛，涵盖合同章。
(2)合同章只能在合同上有用，不能办其他事。
2.执章人不同。
(1)一般公章由公司的法定代表人执掌，法定代表人如果把法定代表人章与公章一同使用就代表公司行为。
(2)合同专用章可由法人执掌，也可由专门的合同人员负责保管。
3.管理部门不同。
(1)公司合同专用章的管理部门一般为法律部门，公司公章的管理部门一般为公司的综合管理部门。
(2)公章在所有印章中具有最高的效力，是法人的权利的象征。
4.权力和确认力不同。
(1)公章在所有印章中具有最高的效力，是法人的权利的象征。凡是以公司名义发出的信函、公文、合同、介绍信、证明或其他公司材料均可使用公章
(2)合同章是单位对外签订合同时使用，可以在签约的范围内代表单位，单位需承受由此导致的权利义务，公章可以代替合同专用章使用
5.刻制不同。
二、分公司合同专用章需要备案吗
刻合同专用章必须要去公安机关备案。不备案，出现与印章真伪有关的争议时，无法保护自身权益。
公司合同专用章的法律意义：对合同当事人而言，合同上加盖合同专用章，表明双方当事人对订立合同的要约、承诺阶段的完成和对双方权利、义务的最终确认，从而确定了合同经当事人双方协商而成立，并对当事人双方发生了法律效力，当事人应当基于合同的约定行使权利、履行义务。
三、公司盖合同专用章有法律效力吗
印章的效力在公司对外的合规管理上一直是一个麻烦事情。要点就在于合同专用章、公章其效力对于对手方，只需进行常识判断即可，即合同签署时合同专用章完全有效，证明文件时公章完全有效。如合同专用章盖在票据上或者财务收据上，一般就不能认为是有效印鉴。友情提醒，只要是符合常识的，则认为其无效的举证，不符合常识而认为其有效的，由其举证。